Юрий, добрый день. Не совсем понятно о каких производственных линиях идет речь? Если это технологическое оборудование, то обычно проектирует линию производители оборудования. А если оборудование уже есть и нужно его просто разместить, то это делают проектные организации.
Знаю на практике что такое производство, вопрос действительно изначально задан весьма поверхностно.