прогоните в разных режимах программой виктория,узнаете есть ли битые сектора,возможно даже востановит их. Ей же можно отформатировать,я после виктории форматировал утилитой SD Card Formatter .После этого форматируется любой встроенной утилитой в винде,даже через нажатия ПКМ.
Для форматирования флешки, есть куча методов, как встроенные в систему, так и внешние, все эти методы описаны в инструкции как форматировать флешку.