Лучший способ, который я видел — через специальный герметик наподобие Berger Aqua-Seal Pafudima FlexFill Color или Sikaflex 11FC. Получается аккуратный, ровный, долговечный шов, не выступающий над поверхностью и по цвету максимально приближенный к напольному покрытию. Соответственно, деформацию компенсирует, глаз не мозолит, служит долго — что ещё нужно?