Большинство льгот пенсионерам - региональные. Есть федеральные - например, освобождение от уплаты ряда налогов для физлиц. Но основные вроде субсидий по ЖКХ, проезда и так далее - устанавливаются на уровне конкретного региона.
Не знаю чем отличаются льготы, но могу точно сказать чего лишается региональный льготник (пенсионер) став федеральным (инвалидом): права на установку бесплатных зубных протезов.