Дейнерис — младшая сестра Рейгара, дочь Эйриса (Безумного Короля) и его законной жены Рейлы. Конечно, никаким бастардом она не является.
И даже если предположить, что кто-то из детей Рейгара, убитых во время восстания, выжил, то он тоже не являлся бы бастардом, поскольку был рождён в законном браке с Элией.
Это никак не связано. Получается что он законнорождённый сын брата Дейнерис, а она в свою очередь - его тётка. А вот когда они это выяснят - получится весьма неловко.
Не понимаю, с чего вы это взяли? Что Джон, что Дени они оба были рождены в законном браке. Соответственно, никто из них не является бастардом.