Если заниматься Йогой как физической активностью, то никаких противоречий нет.
А если уже идти по пути практик и медитаций, то тут могут быть противоречия. так как верующие других конфессий предлагают практики из линии учения Православия, Масульманства, Иудейства и множество других.
Йога есть Индуиская и есть Буддийская,в них так же есть различия)) по этому смотря какие вам нужны инструменты ))
Смотря что подразумевать под йогой. Если та йога, которая гимнастка, то не противоречит. А если та йога, которая есть учение про энергию, чакры и прочее, то могут возникать противоречия с популярными религиями.
Духовно-философские аспекты йоги противоречат канонам авраамических религий, так как любые оккультные практики являются грехом что в христианстве, что в исламе.