Пожалуй и здесь расскажу как мне повезло со школой в этом смысле. Тема религии у нас затрагивалась в основном на истории,обществознании,литературе и только в плане облучения. Никакой ксенофобии по религиозному признаку не было, как и пропаганды православия. Наоборот мы изучали все религии вместе, разбирали их влияние на различные общества(протестантизм на Германию, Православие на Россию/Балканы, Ислам на примере Турции,стран ближнего востока, и особо много говорили о приемлемом и "прогресссивном" албанском варианте), собственно то чем и должны заниматься в школе.
Хотя многие знакомые сталкивались со всей обратной стороной российской образовательной системы- в частности с ненавистью к другим религиозным группам (особенно исламу, свидетелям Иегова и различным ответвлениям православия(тем же староверам, молоканям и пр.), , но, как ее удивительно, не к католикам и протестантам). Да и сам сейчас обучаясь в университете сталкиваюсь с некоторым непониманием и даже ненавистью (особенно к исламу, как к причине всего наихудшего в этом мире).
На самом деле, у нас в школе вообще не говорят про веру и религии. Понимают, что это дело каждого. Я рад, что учусь в такой школе. Может, просто повезло с учителями.