Ну если ты планируешь работать в Воронеже, то лучше ВГТУ, поскольку там ты найдёшь связи именно для своего региона и если ты будешь устраиваться по специальности, то возможно представители компаний будут преподавать у тебя (в моём ВУЗе было так).
Ну а если ты хочешь вырваться из родной провинции, то лучше МФТИ, поскольку ты уже будешь нарабатывать контакты в столице.
Ответ очевиден для всех.
Определяй выбор не из оценок, а из учебных планов, которые предоставляют вузы. Посмотри на киберленинке публикации ключевых преподавателей по твоему направлению и уже реши кто интереснее, а оценки и престиж это шелуха
Троечником в МФТИ однозначно. Причины перечислены в предыдущем ответе. Добавляю свое мнение для полноты. Банально больше путей, возможностей и дорог. Больше стимула стремиться выше и повышать амбициозность.