Что делать, если появляется желание учиться, но после очередной оценки "2" или "3" оно исчезает?

Что делать? Конечно, попробовать заиметь внутреннюю мотивацию. 

Приходится повторяться - в современных условиях процесс обучения будет сводится к личным достижениями, а образовательные структуры (школа, колледж, вуз) только подбирает для вас специалистов, чтобы помочь вам получить знания. Конечно, структура задаёт свои критерии, но ваша работа в дальнейшем поможет отсеить "лишние" знания - вы просто забудете, например, формулу спирта, но не перестанете быть умным человеком, и поможет улучшить ваши знания в нужных областях. 

В случае конфликтов с учителем, разногласиями и другими невозможностями получить хорошую оценку, сформулируйте конкретную цель - зачем мне нужна оценка. 

• Порадовать родителей
• Получить красный диплом, как символ значимый для вас
• Чувствовать превосходство
  Вся эта "школьническая" философия о том что "оценка не показатель знаний" она верна только от части (малой части) так как люди не понимают что такое ставить кому то оценку. И так, оценка состоит из

1. Соответствия вашего знания требованию. Из этого не следует, что ваше знание, помимо требуемого, бесполезно. Но у учителя, со временем, складывается чёткий критерий определения и исходя из него он ставит оценку. 
2. Прямо вытекает способность к рефлексии. Если это оценка ставится за предментные, а не метапредметные результаты, то оценка показатель того - насколько точно вы усвоили нужный материал. Если она не соответствует вашим ожиданиям - поговорите с учителем и попробуйте понять какие критерии вы не выполнили. Если вам удастся его убедить, он исправит вам оценку. На практике, такие молодые педагоги как я (и я в том числе) иногда ошибаются по многим причинам. Не бойтесь спросить. Но ни в коем случае не возмущайтесь во весь голос, это раздражает и не способствует коммуникации. 
3. Ваша оценка это и оценка самого учителя. В том смысле, что он сверяет ваши знания со своими, со своей способностью вас научить и правильно оценить. 
   Не сводите своё образованию к бегу за оценкой, но попробуйте разобраться в чём причина низкой оценки.