В клетках эукариот есть ядро - структура, в которой хранится вся ДНК клетки. В клетках эукариот ядра нет, и ДНК просто плавает в цитоплазме, свернутая в кольцо.
Не вся ДНК эукариотической клетки находится в ядре (митохондриальная ДНК - в митохондриях, пластидная ДНК - в пластидах).