С одной стороны, конечно, эволюция - вовсе не прогресс, это совершенно разные термины.Evolutio (лат.) - развертывание, то есть просто осуществление некоторого процесса, совсем не обязательно, что этот процесс будет вести к лучшему, более совершенному. В биологии эволюция - это процесс изменения видов под действием случайных мутаций и закреплений этих мутаций в популяции под давлением факторов внешней среды. В этом смысле, отпадение хвоста у предков человека или исчезновение конечностей у предков современных китовых - это тоже эволюция, ведь если млекопитающее перебралось в воду, конечности ему больше не нужны. Это уж не говоря про паразитические виды, у которых атрофируются практически все системы органов, кроме пищеварительной. А зачем тебе конечности или, например, мозги, если ты живешь среди еды?
Но с другой стороны, как ни странно, в каком-то смысле можно сказать, что совесть как раз-таки прогрессирует в обществе. Просто для того, чтобы это заметить, нужно знать историю и рассматривать масштаб несколько больший, чем собственное окружение за последние 5 лет.
Пример: Сократ, который жил в 5 в до н.э. обладал неким внутренним "демоном", который подсказывал ему, когда не следует поступать неправильно и молчал, когда поступок был правильным. Похоже на совесть? Очень даже, вот только современники считали Сократа чудаком и даже немного сумасшедшим. Потому что задумываться о "правильности" своих поступков не очень принято было в греческой культуре - почитайте того же Гомера, там герои действуют, вообще не рассуждая ни о чем.
Далее в средневековье совесть начинает воспитываться массово посредством христианских практик - молитвы и исповеди. Человек, приходящий к священнику на исповедь, должен заранее поразмышлять над своей жизнью, оценить совершенные им поступки - все это действительно не появляется само собой, и именно христианство начинает целенаправленно воспитывать в людях такие привычки.
Ну и так далее, можно и более поздние примеры приводить: скажем, конкистадоры или английские поселенцы в северной Америке искренне не считали, будто они делают что-то плохое с аборигенным населением. То, что мы сегодня ужасаемся кошмарам колонизации - признак того, что мы более совестливые, чем 400-500 лет назад.