Никакая. Теория это набор инструментов, который позволяет воспроизводить те или иные явления или как минимум понимать как они работают. В каждой теории есть определенный набор законов, и между ними уже могут возникать противоречия, нестыковки, поскольку каждый отдельный закон имеет свои границы применимости. Противоречивыми могут быть несколько гипотез, ну из прошлого, к примеру, разные модели строения ядра.