Наверное потому что эти два слова, обозначающие одно понятие -ПОЗНАНИЕ но с двух сторон. Метафизика - задает вопросы и делает предположения. Наука - ищет ответ и доказательства.
Если мы хотим воспринимать процесс приобретения знаний, как две половины, то мы должны разделить науку и метафизику, если мы наоборот, хотим воспринимать этот процесс как что-то единое, то мы должны соединить эти половины.