Начать следует с того, что территорию Узбекистана изначально населяли народы, говорившие на восточноиранских языках - согдийцы, бактрийцы, хорезмийцы, сако-массагеты и т.д. и т.п. Тюркоязычное население в Средней Азии пришлое. Оно постепенно заселяло Узбекистан с северо-восточного направления и несколькими волнами. Первая такая волна нахлынула ещё в начале нашей эры с продвижением на запад гуннов. Вторая - с образованием в евразийских степях Тюркского каганата в VI в. Третья - с образованием державы Караханидов в XI в. Четвёртая - с образованием Чагатай Орды в XIII в. Завершение формирования рассматриваемого тюркского этноса связано с миграцией в Среднюю Азию из степей Казахстана собственно "узбеков" - кочевников из восточной части Золотой Орды, подчинявшихся в XIV в. хану Узбеку, а с к. XV в. возглавляемых Шейбани-ханом. Последний в 1501 г. окончательно овладел Самаркандом и объявил себя там "имамом времени и милосердным халифом".
Процесс тюркизации местного иранского населения проходил неравномерно - на равнинах быстрее, чем в горах, а в крупных городах он не был завершён и в новейшее время. Древние иранские города были слишком населены и имели слишком сильную культуру, чтобы наплыв чужеродного населения мог ассимилировать и растворить в себе коренных жителей. Не знаю как сейчас, но в XX в. в Бухаре и Самарканде ещё присутствовал узбеко-таджикский билингвизм и узбекские надписи дублировались таджикскими. Так что Узбекистан и Таджикистан не просто располагаются рядом - таджикский язык является родным для миллионов граждан Узбекистана. Только официальная статистика насчитывает в стране миллион таджиков, но значительно больше граждан Узбекистана только в паспорте записаны узбеками, а на самом деле ими не являются. Поэтому по неофициальным данным численность таджиков в Узбекистане варьируется от 8 до 11 млн. человек. Проще говоря, узбеки - наполовину вчерашние таджики, а до четверти граждан Узбекистана - таджики сегодняшние.