Обе страны (Югославия и Чехословакия) Запад ещё при СССР долго и серьёзно "накачивал" противоречиями, радикалистской литературой, деньгами и т.п. и в решающий момент (примерно начало 90-х), когда национальные элиты должны были сказать да или нет Западу, подтвердив полный отказ от самостоятельности, элиты Чехословакии достаточно легко пошли на это, тем более, что между Чехией и Словакией, как таковых исторических то связей нет, а в Югославии, в основном сербская часть элит отказались выполнять требования Штатов и Британии, после чего Сербия была наказана "за непослушание".
Иными словами, при разделе Чехословакии "большой Босс" - США не активировали, имеющиеся противоречия, а в Югославии сделали это.
Я далёк от мысли, что вся вина исключительно на Общезападе: сербы с хорватами не то чтобы не братья, а похуже врагов будут, но той резни, которую там устроили при благожелательной помощи "цивилизованного мира" можно было избежать, просто выбив (ликвидировав, не знаю, изолировав) основных деятелей националистических течения и сербы наверняка справились бы, но им не дали, но всё произошедшее буквально децимация.