Есть признаки злоупотребления правом пользования.
Существует три вида права: собственность, пользование и распоряжение.
В данном случае прямым текстом сказано, что у арендатора есть право пользования, пусть и бессрочное.
Причем, это право дано только в рамках назначения земельного участка и видов разрешенного использования.
Так же в ГПЗУ есть расширенные данные по видам разрешенного использования, и если там нет пункта о том, что на этом участке есть возможность размещения приюта для животных или просто содержание животных, то Росимущество вполне правомерно действует в данном случае.
Это все равно, что, к примеру, вы арендуете у муниципалитета и пользуетесь бессрочно участком земли в рамках населенного пункта, который предназначен для размещения магазина, и даже построив там магазин ваше право на это пользование этим участком незыблемо. А магазин будет вашей собственностью.
Но вы вдруг решили разместить там скотомогильник, в центре города, потому что у вас есть право пользования. Росимущество по жалобе или просто в рамках проверки, вашу деятельность приостановит, вне зависимости от того сколько вы туда денег вложили.
Вывод прост, изучайте документы (если это не ваша сфера деятельности, обратитесь к специалисту), и всегда хозяйственные отношения должны быть закреплены договором.