Эти состояния можно отличить друг от друга по времени возникновения симптома. Аллергия может появиться после 2х месяцев жизни, ближе к 3м. К этому моменту акне новорожденных уже проходит.
Акне - не болезнь, это кратковременное состояние, продолжительностью не более 2-х недель, исчезающее без лечения. Бывают случаи инфицирования, которые надо контролировать, но они крайне редки.
К сожалению, в последнее время аллергией называют любые проблемы, возникающие у грудных детей, что приводит к необоснованным решениям - назначению строгих диет кормящим матерям и детям.