Ни один из натуральных материалов не используется как есть. Перед применением он проходит ту или иную обработку, призванную его сохранить, придать определенную форму или какие-либо свойства.
Камень тщательно шлифуется. Дерево обрабатывается и покрывается отнюдь не натуральными лаками, к тому же порой перед этим обрабатывается пропитками, призванными защищать его от гниения и насекомых. Ткани изначально не являются натуральными - это продукт обработки натуральных волокон животного или растительного происхождения (или синтетических), пропитанных химическими красителями. Шкуры и кожи так же проходят химическую обработку, так как без неё они быстро приходят в негодность.
Вывод: нетронутых природных материалов НЕ существует.
По поводу самого вопроса: в виде основных предпочёл бы металл, стекло, дерево, ткани, керамику.
Кожа выглядит более богато, но как и кожзам не относится к дышащим материалам, из-за чего сидеть кожаном кресле жарко - потеет спина. По этой причине её исключил из списка.
Дерево - интересный материал, красивый, тёплый, но требовательный к качеству материала перед началом работы с ним, из-за чего у частников можно легко нарваться на бракованное изделие, которое со временем поведет или растрескается (попадал на такое - лучше переплатить в 1,5-2 раза, но получить гарантированное качество у фабрики). В принципе деревянное изделие надежнее чем выполненное из ЛДСП или МДФ. При тщательном уходе меньше боится кратковременного воздействия влаги (лдсп в местах царапин деформируется от влаги). Деревянные изделия хорошо поддаются реставрации в т.ч. в местах крепежа, ремонту при нарушении покрытия, даже деформацию от воздействия влаги или воды можно убрать.
Металл. Стальные изделия требуют качественную защиту от коррозии. Более стойкие - медь, бронза или латунь. Очень нравится внешний вид системы отопления и водоснабжения, выполненный из этих материалов (без никелирования).
Камень. С ним сложно - не все камни подходят для интерьера из-за повышенного радиационного фона (например гранит), и не все подходят для экстерьера из-за нестойкости к атмосферным явлениям (например мрамор). В одном случае требуется проверка материалов на радиоактивность, а в другом - защитное покрытие либо замена на аналоги.