Вообще кошек по разному называют! Если вы услышите что кто-то называет кошку кисой, спросите у этого человека почему он так делает! Думаю мотивация разная в зависимости от ситуации. А вообще вопрос похож на название русской сказки " почему кошку назвали кошкой?". Слово киса , по моему мнению возникло в нашем языке как синоним слова кошка из кого-то другого языка. Учитывая, что Россия много национальная страна и у каждого народа есть свое название для этого аида животного. А ещё наша страна часто вела торговлю с другими народами ( а кошка частый гость на короблях), а также были ученые, архитекторы, художники, политики, мастера из других стран, которые проживали на территории России, да и русские люди ездели в другие страны перенимать опыт, вот и пополнялся русский язык разными словами. Вообще в русской речи много заимствованных из других языков слов.