Не соглашусь с коллегами, - гос.заказчик, т.е. Заказчик, размещающий закупку согласно 44-ФЗ не имеет права устанавливать ограничения в части участия компаний на ОСНО или УСН, как и не имеет права снижать цену контракта, если победитель работает на УСН.
Гос.закупки по 44-ФЗ финансируются полностью из средств бюджета.
В подкрепление данной позиции: https://www.klerk.ru/buh/articles/490299/