Количество элементов фенотипа и вариативность оных у бактерий малы относительно видового разнообразия, поэтому их чрезвычайно сложно дифференцировать – намного сложнее, чем растения и беспозвоночных, и тем более чем позвоночных. Между тем, даже среди зверей различить представителей разных биологических родов нередко бывает сложно: так, среди мышеобразных и землеройковых многих животных не получится классифицировать, не рассмотрев их зубы.