Потому что религия - это некий феномен. Его можно научно изучать. А атеизм, его же нет. Это всего лишь отрицание феномена. Как можно изучать то чего нет?
Но с натяжкой я могу согласится, что "научный атеизм" существует. В качестве исследований. Берем атеизм (утверждение что Бога нет) и НАУЧНО теоретизируем что из этого следует? Например - отсутствие свободы воли (Докинз, Крик, Хокинг) и бессмысленность существования. И само отсутствие понятия смысл.