Не уверен, но agile можно применять в любой сфере или только в разработке?

Agile можно применять в разных сферах, не ограничиваясь разработкой. Важно то, какая это среда — в понятных, сильно регламентированных, давно существующих проблемах Agile не нужен. Но чем более сложная сфера задачи, тем больше пользы принесет Agile. Подробнее про разные среды можно почитать https://en.wikipedia.org/wiki/Cynefin_framework 

Совершенно верно, что Agile манифест (Agile Manifesto) был создан экспертами, авторами разных фреймворков/подходов для управления разработкой программных продуктов. Поэтому в Agile Manifesto упоминается software. Однако ценности универсальны, а принципы Agile необходимо  приземлить на вашу область. Есть знакомые которые в исследовательской медицинской организации уточняли принципы, уточняли как могу быть записаны принципы с учетом медицинской специфики. 

Есть примеры применения Agile в ремонте домов, разработке автомобилей, создании 3D-домов. 

В книге Джефа Сазерленда описывается пример пересоздания спец-подразделений по принципам а-ля Agile, для повышение эффективности решения их задач. 

Такие дела :)