1) Потому что подводные лодки гораздо медленнее не только самолётов, но даже и простых автобусов, поездов, а для их обслуживания требуется куда большее количество специалистов, и куда более развитая инфраструктура хабов, чем у любого наземного транспорта, с которым он, по идее, мог бы конкурировать.
...
2) Плюс - как вы себе представляете пассажирскую подводную лодку, например, в среднем течении Оки? Правильно. С трудом. Для того, чтобы окупиться, ППЛ (назовём её так) должна быть достаточно большой, но будучи таковой, она "не пролезет" в небольшую реку. Ограничивать же использование ППЛ Нилом и Амазонкой, выпускать тихоход в открытое море, чтобы из точки А в точку B пассажиры добирались неделю..а, к чёрту. Слишком с ними много мороки, с этими ППЛ.. :)