Скорее всего в результате неправильного расчета при укладке рельса не были соблюдены нормы, например, расстояние между рельсами (стык) был меньше нужного. Из-за этого при нагревании (смене погоды) рельс расширился и удлинился. Создалось напряжение и когда рабочие расслабили т.н. "глухари" - путевые шурупы - рельс деформировался.
Как вариант, деформация рельса была вызвана чрезмерной нагрузкой при движении по нему состава. например, пробуксовкой, или же провалом грунта под рельсом.