Вы ошибаетесь. Возникает не большой кратковременный ток - импульс.
Потенциалы пластин относительно земли ( и соответственно друг друга) с очень высокой вероятностью различны, поэтому при замыкании они неизбежно выровняются. Но величина заряда между этими пластинами обычно очень мала, поэтому вы вероятно не сможете наблюдать падение заряда на каждом из конденсаторов. Более точно можно рассудить если будут известны конкретные условия опыта.
Вообще, на этом принципе, перекоммутации конденсаторов, строят умножители напряжения и генераторы высокого напряжения.