Что стоит сделать для гарантии сохранности своих файлов, паролей?

Всем читающим добрый день! Выполнял школьную работу по информатике на своем компьютере, когда настал день сдачи проекта, то перенёс свою законченную  работу на флешку и дабы показать ее учителю, подключил ее к школьному компьютеру, прийдя домой мне снова понадобилась флешка, подключил к своему компьютеру и системой защиты был обнаружен вирус, а именно - троян. Сделав полное сканирование, антивирус вроде как все удалил, но я не могу быть полностью в этом уверен. Что лучше сделать в данном случае? Как обезопасить свою конфиденциальность, сохранность паролей? Стоит ли переустанавливать систему, чтобы быть в полной уверенности отсутствия сторонних файлов на компьютере? И что в целом посоветуете? Заранее спасибо. Столкнулся с данной проблемой впервые в жизни.