Ответ зависит от маршрута космического корабля. На околоземных орбитах ядерный реактор как источник электроэнергии в настоящее время не считается перспективным. Удельная мощность (производство электроэнергии в расчёте на килограмм массы) солнечных батарей на околоземной орбите выше, чем у ядерного реактора, их технология лучше отработана и они заведомо безопаснее. Поэтому, если в не произойдёт никаких крупных технологических скачков в области ядерной энергии, то ядерные реакторы не вернутся в обозримом будущем на околоземные орбиты. (Американцы испытывали орбитальный ядерный реактор в 60, СССР эксплуатировал некоторое количество спутников, оснащённых ядерными реакторами. Произошло также несколько потенциально опасных инцидентов - и в США, и в СССР).
На более далёких от Солнца маршрутах эффективность солнечных батарей снижается (при увеличении расстояния от Солнца вдвое эффективность солнечных батарей падает вчетверо). Поэтому на больших расстояниях - планеты-гиганты, а тем более транснептуновые объекты - ядерные источники энергии востребованы. Сегодня это РИТЭГи - устройства, преобразующие в электроэнергию тепло, выделяемое при естественном распаде некоторых изотопов. В будущем могут оказаться востребованными и ядерные реакторы, так как они производят больше энергии на килограмм масс по сравнению с РИТЭГами.
Ядерный реакторы в принципе могут использоваться как источник энергии для ракетного двигателя. При этом может быть использована непосредственно тепловая энергия реактора (а не электрическая), и такой двигатель может оказаться перспективным уже для полётов, к примеру, к Луне. Современный уровень технологий вполне достаточен для решения проблем, с которыми связано создание такого двигателя (экспериментальные двигатели были созданы уже в 60-х годах и в СССР, и в США). Возможно, одной из главных проблем может стать общественное мнение: запуск ядерного реактора на ракете потенциально опасен и потому у многих не вызывает большого энтузиазма.