Да, есть такая гипотеза. Причём в 1978 году в заслуженном научном журнале Icarus, вышла статья Фландерна и Харрингтона, с расчетами, которые хорошо объясняли текущую необычную орбиту Меркурия. Эта гипотеза сейчас не является общепринятой, но и не опровергнута.
Но это не единственная гипотеза, к примеру существует модель столкновения прото-Меркурия с прото-Венерой на заре формирования Солнечной системы.