Заберут ли в армию, если после окончания первого курса в колледже переведусь в вуз, а первую отсрочку получу в конце первого курса в пту?

Да, призовут на военную службу. 

Право на отсрочку от призыва на военную службу предоставляется гражданам на основании обучения в колледже и в ВУЗе в соответствии с пп. «а» п. 2 ст. 24 N 53-ФЗ «О воинской обязанности и военной службе». Указанным подпунктом закона предусмотрено, что отсрочка предоставляется только один раз (и предусмотрены исключения, но Ваш случай не подпадает под исключение).