Добрый день, Владимир.
Жесткие диски не горят. Они могут "сыпаться" или просто выходить из строя. Так что ваши излишние опасения напрасны.
Своими действиями насколько я понимаю, Вы попортили загрузочную область операционной системы. Самое простое решение в вашей ситуации заново переустановить ОС Windows.
Установите её на обычный внутренний жёсткий диск. Если сомневаетесь в его исправности, то сперва замените его на новый диск и установите Windows туда.
P.S.: Устанавливать Windows на внешний жесткий диск плохая идея, так как внешние накопители не предназначены для этого.