Давайте начнём с того, что никакого научного определения "души" на данный момент мы не знаем, это скорее понятие абстрактное и теософское, а вот вирусы и бактерии вполне конкретны. Что такое "душа", каждый человек определяет для себя сам, руководствуясь своими познаниями в философии, религии и науке. Тем не менее, вирусы и бактерии вполне способны влиять на наше состояние, как физическое, так и эмоциональное. Дело в том, что вирусы и бактерии в наших телах ведут активную жизнедеятельность; они размножаются, питаются и умирают. Вирусы, например, размножившись в
живой клетке организма, разрушают её и выходят наружу, чтобы заразить и сожрать другие клетки. Бактерии же являются полноценными живыми организмами, выделяющими, как всё живое, отходы жизнедеятельности, поэтому они так или иначе участвуют в биохимии организма, в котором живут. Некоторые микроорганизмы выделяют вещества, полезные для человека (например, бактерии, живущие в нашем кишечнике и помогающие правильно усваивать пищу). Некоторые другие вещества, вырабатываемые "микробиотой", способны напрямую влиять на эмоциональное состояние, так как многие вещества в теле человека так или иначе являются нейромедиаторами, ответственными за наше настроение, или имеют к ним отношение. Известно, например, что вирусы, вызывающие грипп, могут делать человека более общительным, а возбудители токсоплазмоза вызывают, помимо любви к кошкам, ещё и немотивированные вспышки агрессии. В свою очередь, необоснованное или неправильное употребление антибиотиков способно довести человека до эмоционального истощения и серьёзной депрессии. Имеют ли данные факты отношение непосредственно к душе - решать вам.