В российские проекты европейские инвесторы, а Эстония это Европа, вкладываются только при условии, что проект релоцирован и, в идеале, уже имеет выручку на европейском рынке.
Поэтому если есть потребность именно в европейских деньгах - рассмотрите создание компании в Эстонии или одной из европейских стран и дальше открывается уже много возможностей.
Касательно конкретных институтов, то можно рассмотреть акселераторы как источник финансирования и как ступеньку к более серьезным инвестициям:
Если готовы сразу идти в фонд, то вот несколько топовых эстонских: