Здравствуйте. Может ли собственник выписать из квартиры чужого ребенка?

Да может.

В настоящее время нет никаких законодательных запретов, что бы снять с регистрационного учета несовершеннолетнего, который не является собственнику членом семьи.

Единственное, чего может добится в суде ответчик, отсрочить исполнение решения суда.