Если говорить о действующих в настоящее время и популярной у пользователей, то это безусловно Яндекс. С 1997 года по сегодняшний день, корпорация Яндекс представляет труд российский специалистов на мировой арене.
Если говорить в принципе про поисковые системы, то ещё два отечественных поисковика в разный период времени работали в рунете, но сейчас перестали функционировать (или находятся в процессе долгой стагнации) и ещё две системы работают, но мало востребованы (пользовательский спрос не более 1-2%):
Забавный факт, Яндекс является 4ой поисковой системой в мире по количеству обработанной информации. При этом, на текущий момент самая популярная в России поисковая система это Google.