Скорее всего, нет. Скорость течения времени - вещь субъективная, и определяется относительной скоростью течения наблюдаемых процессов. Основные наблюдаемые человеком процессы - смена дня и ночи, времен года, скорость механического движения тел - не изменятся существенно из-за колебаний атомов. Но вот для человека на другой планете, с другим суточным и годичным ритмом, понимание времени изменится существенно.