В тоталитарных странах государство требует регистрации любых сообществ.
Другая причина организационная, когда община вырастает больше домашней группы. Необходимость аренды помещения, ведение хозяйственной деятельности, заключение договоров на услуги, открытие банковских счетов и так далее.
Есть деструктивные церкви и религиозные организации, которые опасны для человека по разным причинам.
Государство с законом о регистрации религий стремится защитить общество от деструктивных сект.