В Москве много городов (Химки, Мытищи, и т.д.), а сама Москва это только Кремль?

Лол, ну вообще-то, в Москве есть другие города: Москва собственно, Зеленоград, Троицк и ряд других поселений. 

Мытищи, Химки итд – это всё Красногорская (то есть Московская) область. 

Сама Москва в привычном понимании – это всё внутри МКАД. Но с 2011-го Москва ушла далеко на юг. Что считать Москвой – дело исключительно каждого. Хотя когда-то вся Москва была одним Кремлём, это да.