Из того что я слышала и читала, Гиперборея собирательное название древних греков для народов, населявших северные регионы Евразии. Так что как таковой цивилизации или государства не было.
Я думаю, тут также как и с "Землей Санникова". Может было как вулканический остров и потонуло, может не было - никто не узнает.
Хотя, те же греки писали про Атлантиду. Про которую все говорят что Платон её выдумал.