Для начала читаете "Статью о греческом государстве"
Затем наслаждаетесь художественным содержанием Заратустры.
Потом "Эссе Хомо", "Антихристианин" и там уже неважно в какой последовательности читать все крупные книги. Учтите, что "По ту сторону добра и зла" это сборник афоризмов, так что читайте его уже под конец ознакомления.