При оформлении перевыпуска ничего не списывается. А при получении карты в отделении сразу попросите сотрудника отключить уведомления по карте. Потом в приложении или Сбер Онлайн включите, если надо.
Кстати о перевыпуске. По собственному опыту. Перевыпуск был плановый - карта кончилась. В отделении выдали новую карту и сказала, что старая теперь неактивна (при прошлом перевыпуске так оно и было). Но карта еще месяц была активна! Можно было расплачиваться, переводить с нее деньги. И переводы все по-умолчанию шли на старую!
Дальше больше. Неактивной она стала с 1 числа следующего месяца - апреля. А в июне с нее списали 60 рублей за уведомления! Причем с новой карты тоже за уведомления деньги списываются. Пришлось еще блокировать вручную. Так что как получите новую, лучше старую заблокировать вручную.