Если немного вдаться в теорию, то бег - это контролируемое падение, предупреждаемое приземлением на выброшенную вперед ногу )) Так что нет ничего страшного в этом.
Более того, правильная техника бега подразумевает постановку стопы под центр тяжести, "под себя". Скорее всего, у вас просто ощущение, что ноги сзади оказались. Это нормально.
Но можно посмотреть на себя на видео - возможно сильно корпус вперед заваливаете. Сравните свою технику с техникой других бегунов.