Я думаю примут. Туда ведь принимают на основе егэ, либо вступительных экзаменов. Другое дело, что оценки в аттестате влияют на Ваш рейтинг в списке поступления. Например, поступаете по ЕГЭ и у Вас 200 баллов и троек нет. Туда же поступает еще кто-нибудь и у него тоже 200 баллов, но еще есть тройка. В итоговом списке, при прочих равных условиях, Вы окажетесь выше него, что увеличит шансы на поступление.