Постоянно пью бутилированную воду и тоже замечал этот эффект - появляется запах, отдалённо напоминающий герань. Особенно хорошо это заметно, если оставить бутылку в машине на весь день. Опытным путём было установлено, что:
ПЕТ бутылки пропускают немного ультрафиолета, дальше сами понимаете...
Это от контакта слюны с пластиком. Так же изо рта воняет, если зубы не чистить. Пользуйтесь стаканчиками одноразовыми или купите пакетик с соломинками и пользуйтесь ими, в общем, если не облизывать бутылку, то этого запаха не будет