Извините, не правильно посмотрела на год, я отвечала про 2020 год, а не 2000 год.
Да вернут именно с этой суммы 13%, т.е. 21000*13%=2730, при этом право на вычет вы потеряете, т.к. раньше можно было получить вычет только с одного жилья. Поэтому если планируете покупать еще что-то, то лучше получить вычет с новой покупки.