Скорее всего это простая случайность. Так как у героев были совершенно разные "разработчики" , то и способности и логика их расположения может быть разной. Эти герои придумывались еще до DotA Allstars (пользовательская карта для Warcraft 3) и уж тем более до DOTA 2, придумывались разными людьми и только впоследствии их собрали в одном месте (как раз с той самой Allstars версии). А не стали менять расположение, возможно, из-за того, что все уже привыкли. Ну или это просто никому было не нужно.
Возможно создатели как бы намекают что эти способности ключевые у данных героев,опираясь на лор,конечно же. Какой из магины ненавистник магии если не его манабрик?)