Скорее всего у вас портиться что-то мясное или рыбное. Переберите все и промойте все загрязнённые места. Ещё на сладкое мухи падки. Закрывайте всю еду, особенно в жару. Скоропортящиеся продукты убирайте в холодильник. И повесьте на двери и окна москитные сетки.
Потому что с наступлением холодов они ищут, где им перезимовать. И выбирают для этого тёплые места) Заползают в щели, залетают в открытые двери и окна. Если мухи всё же залетели, то воспользуйтесь фумигаторами.