Почему считается что Гомосексуальность не является мутацией в геноме, которую ещё просто не нашли?

Как раз наоборот, считается, что в гомосексуальности гены играют роль. Те же исследования на братьях показали, что у однояйцевых близнецов шанс иметь одинаковую ориентацию выше. Современная научная точка зрения заключается в том, что на формирование ориентации оказывают влияние в том числе и гены, но в первую очередь, внутриутробное развитие. Социальные факторы играют незначительную роль и влияют на поведенческие проявления ориентации.
Говорить о гене гомосексуальности, скорее всего, нельзя. Вероятно, за склонность к гомосексуальности отвечает комбинация из нескольких генов. С полгода назад в научном рецензируемом журнале Scientific Reports выходила статья, что, возможно, найдены некоторые генные маркеры, однако это пока предварительное исследование, проведённое на маленькой выборке (то есть его ещё надо повторить с большим числом участников, чтобы убедиться, что эти гены у испытуемых совпадали не по случайным причинам, а именно из-за гомосексуальности).

То есть сами гены пока не нашли, но по косвенным данным можно сказать, что они имеют значение. Проводя аналогию, если у меня на столе все железки притягиваются в одну точку, то логично предположить, что где-то внутри всё же спрятан магнит, даже если я его пока не нашёл (это к комменту о том, что вот когда найдут, тогда и будут считать).

Ну и в целом стоит отметить, что изучается, к сожалению, в основном мужская гомосексуальность. И хотя по логике, у женщин должен быть похожий механизм, с конкретными данными там более напряжённо.