Предложу 3 варианта, сразу пришедшие в голову:
1) Задвижка не до конца перекрывает трубу. Возможно, дальше за ней есть разрушения, невидимые снаружи, но которых достаточно, чтобы обеспечивать нормальную тягу.
2) Где-то образовалось отверстие, пропускающее дым в обход задвижки.
3) Возможно, в печи несколько задвижек, например, у моей бабушки в одной из вариаций русской печи было несколько задвижек, которые использовались в разные времена года.
Не зная строение конкретной печи, ответить, где именно могут быть нарушения, и есть ли они, невозможно.