Выскажу чисто свое мнение без доказательств, извините.
Чехи и словаки были в Австро-Венгрии. После Первой Мировой они получили независимость и была создана Чехословакия. Выживать всегда проще вместе, поэтому сильной тяги к разделу не было. Когда распался СССР там так же начались процессы размежевания. Национальные элиты как и у нас решили разделить страну. Центральная власть была слабой, а кроме того много лет в Словакии была автономия со своими органами власти, чего не было в Чехии. Ну и еще один момент, Чехия была промышленной, а Словакия более аграрной. Даже были моменты национализма, пренебрежительного отношения горожан-чехов к деревенщинам-словакам. Естественно это не могло играть консолилирующую роль.